螺桿式冷水機組的停機分為正常停機、緊急停機、自動停機和長期停機。正常停機的操作方法是將手動卸載控制裝置置于卸載位置。關閉冷凝器與蒸發器之間供液管線上的電磁閥和出液閥。停止壓縮機，同時關閉其吸入閥。能量降至零后，停止油泵。將能量調節裝置置于“停止”位置。關閉油冷卻器冷卻水進口閥。停止冷卻水泵和冷卻塔風扇的運行。停止制冷劑泵。關閉主電源。

螺桿式冷水機機組緊急停機。螺桿式制冷壓縮機運行正常時如發規異常現象，為了保護機組的安全，應實施緊急停機。操作方法為：停止壓縮機。關閉壓縮機的吸入閥。關閉供液管電磁閥和冷凝器出液閥。停止油泵工作。關閉油冷卻器的冷卻水進水閥。停止冷媒水泵、冷卻水泵和冷卻塔風機。切斷總電源。機組在運行過程中出現停電、停水等故障時的停機方法可參照離心式壓縮機緊急停機中的有關內容處理。機組緊急停機后，應及時查明故障原因，排除故障后，可按正常啟動方法重新啟動機組。

螺桿式冷水機組的自動停機。螺桿式冷水機組運行期間，如果機組壓力和溫度超過規定范圍，機組控制系統中的保護裝置將生效并自動停止壓縮機。這種現象稱為機組自動停機。當機組自動停機時，機組電氣控制面板上的相應故障指示燈將點亮，以指示故障位置。發生這種情況時，主機停機后，可根據緊急停機方法處理停機操作的其他部分。停機操作完成后，應檢查機組，排除故障后可重新啟動正常啟動程序。

螺桿式冷水機組的長期停機。由于螺桿式冷水機組的季節性運行，機組停機時間較長。為確保機組安全，在季節性停堆期間，可按以下方法進行停堆操作。機組正常運行時，關閉機組出液閥，使機組進行減載運行，將機組中的制冷劑全部抽至冷凝器中。為使機組不會因吸氣壓力過低而停機，可將低壓壓力繼電器的調定值調為0.15MPa。當吸氣壓力降至0.15MPa左右時，壓縮機停機，當壓縮機停機后，可將低壓壓力值再調回。將停止運行后的油冷卻器、冷凝器、蒸發器中的水卸掉，并放干凈殘存水，以防冬季時凍壞其內部的傳熱管。關閉好機組中的有關閥門，檢查是否有泄漏現象。每星期應啟動潤滑油油泵運行10～20min，使潤滑油長時間均勻分布在壓縮機各工作面上，防止機組長時間缺油，造成機件表面缺油，重啟困難。